Der Standort und sein Hinterland gingen zurück und wurden schließlich aufgegeben, wahrscheinlich wegen der Umweltzerstörung, obwohl vorgeschlagen wurde, dass Krankheiten, Klimawandel, gesellschaftlicher Stress und Kriegsführung dazu beigetragen haben könnten Faktoren., Die Bevölkerung stellte erhebliche Anforderungen an die Holzressourcen für Brennstoff und Bau und, während der ersten Jahrhunderte der Besetzung der Stadt, räumte die Wälder stromaufwärts des Geländes. Die entblößte Wasserscheide führte zu stark erhöhten Abfluss -, Erosions-und nicht messbaren Sommerfluten auf den Feldern von Cahokia, wodurch die Ernte ausfiel und die Gesamtproduktion zurückging. Die wirtschaftlichen und sozialen Folgen waren katastrophal, was wahrscheinlich zu Hunger, Verlust des Glaubens an die Führung, verstärktem Wettbewerb um Land und regionaler Kriegsführung führte., Während dieser Zeit bauten die Bewohner mit enormem Aufwand eine Reihe palisadierter Holzbefestigungen—ein klarer Beweis für äußere Bedrohungen, die zuvor nicht bestanden hatten. Die Stadt wurde langsam aufgegeben und ihre Bewohner zogen nach Osten, Süden und Westen, wo sie höchstwahrscheinlich von anderen indianischen Gruppen assimiliert wurden.,
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Archäologen studiert haben, Cahokia seit den späten 19th Jahrhundert, aber nur ein winziger Prozentsatz der Stätte ausgegraben wurde. Forscher haben versucht zu bestimmen, wann jeder Hügel gebaut wurde und zu welchen Zwecken, wie und wann die Elite und die gemeinsamen Nachbarschaften gegründet wurden, wie die verschiedenen Klassen (z. B. Arbeiter, Handwerker und Eliten) interagierten und wie Cahokia mit seinem Hinterland interagierte, einschließlich seiner Vororte., Sie haben auch versucht, genau die Anzahl der Menschen zu bestimmen, die in Cahokia lebten (Schätzungen reichen von einem Höchststand von 8.000 bis 40.000) und die berufliche Zusammensetzung der Gesellschaft. Ein Interpretationszentrum auf dem Gelände umfasst ein neu geschaffenes Dorf und Informationen über das Gelände. Die Erhaltungsbemühungen konzentrierten sich auf den Erwerb weiterer Hügelflächen für die staatliche historische Stätte und die Bekämpfung der Hügelerosion, insbesondere der katastrophalen Hangausfälle, die seit Mitte der 1980er Jahre auf der Ost-und Westseite des Hügels aufgetreten sind.