Small nuclear ribonucleoproteins (nebo snRNPs) tvoří funkční splicesome na pre‑mRNA a katalyzují sestřih.
a.“ U “ RNA a související proteiny. Malé jaderné RNA (snRNA) jsou asi 100 až 300 nts dlouhé a mohou být hojné jako 105 až 106 molekul na buňku. Jsou pojmenovány u následované celé číslo. Hlavní zapojené do spojování jsou U1, U2, U4/U6 a U5 snRNAs. Jsou konzervovány z kvasinek na člověka., SnRNA jsou spojena s bílkovinami za vzniku malých jaderných ribonukleoproteinových částic nebo snRNPs. SnRNPs jsou pojmenovány pro snRNAs, které obsahují, a proto Hlavní, které se podílejí na spojování, jsou U1, U2, U4/U6, U5 snRNPs.
jedna třída proteinů společná mnoha snRNPs jsou SM proteiny. Existuje 7 proteinů Sm, nazývaných B / B‘, D1, D2, D3, E, F, G.každý protein Sm má podobnou strukturu 3-D, skládající se z alfa spirály následované 5 beta vlákny. Proteiny SM interagují prostřednictvím beta pramenů a mohou tvořit kruh kolem RNA.,
určitá sekvence společná mnoha snRNA je rozpoznána proteiny Sm a nazývá se „motiv SM RNA“.
b. použití protilátek od pacientů se SLE., Několik společných snRNPs jsou uznávány autoimunitní séru proti Sm, původně vytvořené u pacientů s autoimunitní onemocnění Systémový Lupus Erythematosis. Jedním z kritických raných experimentů, které ukazují význam snRNPs při spojování, byla demonstrace, že antiséra anti-sm je silným inhibitorem vitrosplicingových reakcí. Proto jsou cíle antiséra, tj. proteiny Sm v snRNPs, potřebné pro spojování.
c. Na snRNPs sestavit na pre-mRNA, aby se velké protein-RNA komplex nazývá spliceosome (Obrázek 3.3.17)., Katalýza sestřihu nastává ve spojitostiosom. Nedávné studie podporují hypotézu, že snRNA složky spliceosomu skutečně katalyzují sestřihu a poskytují další příklad ribozymů.
d. U1 snRNP: Váže na 5′ splice site, a U1 RNA tvoří základnu‑párové konstrukce s 5′ splice site.
e. U2 snRNP: váže se na bod větve a tvoří krátký duplex RNA-RNA., Tento krok vyžaduje pomocný faktor (u2af) a ATP hydrolýzu a zavazuje pre-mRNA ke spojovací dráze.
f. U5 snRNP plus U4, U6 snRNP se nyní váží na sestavení funkčního spliceosome. Důkazy naznačují, že U4 snRNP odděluje od U6 snRNP ve spliceosome. To pak umožňuje U6 RNA vytvářet nové báze spárované struktury s U2 RNA a pre-mRNA, které katalyzují transesterifikační reakci (fosfoesterové transfery)., Jeden model je, že U6 RNA páruje s 5′ splice site a s U2 RNA (což samo o sobě je spárováno na pobočku bod), čímž větev bod v blízkosti 5′ splice site. U5 RNA může sloužit k tomu, aby držela blízko sebe konce exonů, které mají být spojeny.