vědecké myšlení Carla Linnaeuse začalo přirozenou teologií. Vzhledem k jeho náboženským přesvědčením věřil, že je možné najít porozumění Bohu tím, že se podíváme na jeho výtvory. V části Systema Naturae vysvětlil, jak si myslel, že božský řád Božích výtvorů bude možná odhalen studiem přírody a jejího původu.
Linnaeusova láska k botanice přinesla jeho první taxonomické kategorie rostlin. Založil každou skupinu rostlin na počtu a uspořádání reprodukčních orgánů rostliny., To není práce, stejně jako Linnaeus plánované, protože je vytvářen systém, který byl velmi nepřirozený v tom smyslu, že to ani porovnávat mnoho dalších podobností a rozdílů, které jsou důležité pro kategorizaci rostlin. Nejprve rozdělil rostliny do velké skupiny (?), a pak použil menší kategorie k další diverzifikaci rostlin. Dal každé rostlině dvě jména, která jsou původem binomické nomenklatury. Tato forma klasifikace byla v průběhu let upravena a dodnes se používá.
Binomická nomenklatura se skládá ze dvou latinských názvů daných organismu., První je název rodu, ke kterému organismus patří, označovaný také jako generický epithet. Rody jsou dále rozděleny na druhy, identifikované specifickým epitetem (druhá část jména). Kombinace těchto dvou názvů kategorií vytváří vědecký název organismů. I když Linnaeus nebyl (?) jako první použil binomický pojmenovací systém, jako první jej používal dostatečně často, aby ho vědci všude přijímali a používali častěji.
Linnaeusovy myšlenky na evoluci se velmi liší od moderních teorií., Věřil, že druhy jsou neměnné. I když Linnaeus věřil v neměnnost, věřil, že vytvoření nových druhů je možné, ale že je omezené. (?)
Linnaeus byl otcem taxonomického a dal nám binomický systém pojmenování a klasifikace organismů.