Små nukleare ribonucleoproteins (eller snRNPs) danner funktionelle splicesome på pre‑mRNA og katalysere splejsning.

a. “U” RNA ‘ er og tilknyttede proteiner. Små nukleare RNA ‘er (snrna’ er) er omkring 100 til 300 nts lange og kan være lige så rigelige som 105 til 106 molekyler pr. De hedder U efterfulgt af et heltal. De vigtigste involverede i splejsning er U1, U2, U4/U6 og U5 snRNAs. De er konserveret fra gær til menneske., SnRNAs er forbundet med proteiner til dannelse af små nukleare ribonukleoproteinpartikler eller snrnp ‘ er. Snrnp ‘erne er opkaldt efter snRNAs de indeholder, hvorfor de største involverede i splejsning er U1, U2, U4/U6, U5 snrnp’ er.

en klasse af proteiner, der er fælles for mange snrnp ‘ er, er Sm-proteinerne. Der er 7 SM-proteiner, kaldet B / B’, D1, D2, D3, E, F, G. hvert SM-protein har lignende 3-D-struktur, der består af en alfa-Heli.efterfulgt af 5 beta-strenge. Sm-proteinerne interagerer via beta-strengene og kan danne en cirkel omkring RNA.,

Figur 3.3.17). Det højre panel viser interaktioner mellem Sm-proteinerne gennem deres beta-strenge for at fremstille en ring med en indre del, der er stor nok til at omslutte et RNA-molekyle. Fra Angus I. Lamond (1999) Nature 397, 655 – 656 “RNA splejsning: løberinge omkring RNA.”

en bestemt sekvens, der er fælles for mange snrna ‘ er, genkendes af Sm-proteinerne og kaldes “SM RNA-motivet”.

b. anvendelse af antistoffer fra patienter med SLE., Flere af de almindelige snrnp ‘ er genkendes af det autoimmune serum kaldet anti‑SM, oprindeligt genereret af patienter med den autoimmune sygdom systemisk Lupus Erythematose. Et af de kritiske tidlige eksperimenter, der viser betydningen af snRNPs i splejsning, var demonstrationen af, at anti-sm antisera er en potent hæmmer af i vitrospliceringsreaktioner. Således er målene for antisera, dvs. Sm-proteiner i snRNPs, nødvendige til splejsning.

c. snrnp ‘ erne samles på præ-mRNA for at fremstille et stort protein-RNA-kompleks kaldet et spliceosom (figur 3.3.17)., Katalyse af splejsning forekommer inden i splejseosomet. Nylige undersøgelser understøtter hypotesen om, at snRNA-komponenterne i splejseosomet faktisk katalyserer splejsning, hvilket giver et andet eksempel på Ribo .ymer.

Figur 3.3.17. Spliceosome forsamling og katalyse

l. U1 snRNP: Binder sig til den 5′ splice site, og U1 RNA danner en base‑parret struktur med 5 ” splice site.

e. U2 snRNP: binder til grenpunktet og danner en kort RNA-RNA duple.., Dette trin kræver en hjælpefaktor (U2AF) og ATP-hydrolyse og forpligter præ-mRNA til splejsningsvejen.

f. U5 snRNP plus U4, U6 snRNP binder nu for at samle det funktionelle spliceosom. Beviser tyder på, at U4 snRNP adskiller sig fra U6 snRNP i spliceosomet. Dette tillader derefter U6 RNA at danne nye baseparrede strukturer med U2 RNA og det præ-mRNA, der katalyserer transesterificeringsreaktionen (phosphoesteroverførsler)., En model er, at U6 RNA par med 5 ‘splejsningsstedet og med U2 RNA (som i sig selv er parret til grenpunktet), hvilket bringer grenpunktet tæt på 5’ splejsningsstedet. U5 RNA kan tjene til at holde tæt sammen enderne af de eksoner, der skal sammenføjes.

Articles

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret. Krævede felter er markeret med *