Små nukleare ribonucleoproteins (eller snRNPs) danner funktionelle splicesome på pre‑mRNA og katalysere splejsning.
a. “U” RNA ‘ er og tilknyttede proteiner. Små nukleare RNA ‘er (snrna’ er) er omkring 100 til 300 nts lange og kan være lige så rigelige som 105 til 106 molekyler pr. De hedder U efterfulgt af et heltal. De vigtigste involverede i splejsning er U1, U2, U4/U6 og U5 snRNAs. De er konserveret fra gær til menneske., SnRNAs er forbundet med proteiner til dannelse af små nukleare ribonukleoproteinpartikler eller snrnp ‘ er. Snrnp ‘erne er opkaldt efter snRNAs de indeholder, hvorfor de største involverede i splejsning er U1, U2, U4/U6, U5 snrnp’ er.
en klasse af proteiner, der er fælles for mange snrnp ‘ er, er Sm-proteinerne. Der er 7 SM-proteiner, kaldet B / B’, D1, D2, D3, E, F, G. hvert SM-protein har lignende 3-D-struktur, der består af en alfa-Heli.efterfulgt af 5 beta-strenge. Sm-proteinerne interagerer via beta-strengene og kan danne en cirkel omkring RNA.,
en bestemt sekvens, der er fælles for mange snrna ‘ er, genkendes af Sm-proteinerne og kaldes “SM RNA-motivet”.
b. anvendelse af antistoffer fra patienter med SLE., Flere af de almindelige snrnp ‘ er genkendes af det autoimmune serum kaldet anti‑SM, oprindeligt genereret af patienter med den autoimmune sygdom systemisk Lupus Erythematose. Et af de kritiske tidlige eksperimenter, der viser betydningen af snRNPs i splejsning, var demonstrationen af, at anti-sm antisera er en potent hæmmer af i vitrospliceringsreaktioner. Således er målene for antisera, dvs. Sm-proteiner i snRNPs, nødvendige til splejsning.
c. snrnp ‘ erne samles på præ-mRNA for at fremstille et stort protein-RNA-kompleks kaldet et spliceosom (figur 3.3.17)., Katalyse af splejsning forekommer inden i splejseosomet. Nylige undersøgelser understøtter hypotesen om, at snRNA-komponenterne i splejseosomet faktisk katalyserer splejsning, hvilket giver et andet eksempel på Ribo .ymer.
l. U1 snRNP: Binder sig til den 5′ splice site, og U1 RNA danner en base‑parret struktur med 5 ” splice site.
e. U2 snRNP: binder til grenpunktet og danner en kort RNA-RNA duple.., Dette trin kræver en hjælpefaktor (U2AF) og ATP-hydrolyse og forpligter præ-mRNA til splejsningsvejen.
f. U5 snRNP plus U4, U6 snRNP binder nu for at samle det funktionelle spliceosom. Beviser tyder på, at U4 snRNP adskiller sig fra U6 snRNP i spliceosomet. Dette tillader derefter U6 RNA at danne nye baseparrede strukturer med U2 RNA og det præ-mRNA, der katalyserer transesterificeringsreaktionen (phosphoesteroverførsler)., En model er, at U6 RNA par med 5 ‘splejsningsstedet og med U2 RNA (som i sig selv er parret til grenpunktet), hvilket bringer grenpunktet tæt på 5’ splejsningsstedet. U5 RNA kan tjene til at holde tæt sammen enderne af de eksoner, der skal sammenføjes.