den videnskabelige tænkning af Carl Linnaeus begyndte med naturlig teologi. På grund af hans religions tro troede han, at det var muligt at finde en forståelse af Gud ved at se på hans skabninger. I en del af Systema Naturae forklarede han, hvordan han troede, at den guddommelige orden af Guds skabelser muligvis ville blive afsløret ved at studere naturen og dens oprindelse.
Linnaeus’ kærlighed til botanik bragte sine første taksonomiske kategorier til at være planter. Han baserede hver gruppe af planter på antallet og arrangementet af plantens reproduktive organer., Dette ikke virker så godt, som Linné planlagt, fordi det skabte et system, der var meget unaturlige i den forstand, at det ikke sammenligne mange andre ligheder og forskelle, der er vigtige for kategorisering af planter. Han adskilte først planterne i en stor gruppe (?mindre kategorier for yderligere at diversificere planterne. Han gav hver plante to navne, som er oprindelsen af binomial nomenklatur. Denne form for klassificering er blevet ændret gennem årene og bruges stadig i dag.
Binomial nomenklatur består af de to latinske navne givet til en organisme., Den første er navnet på den slægt, som organismen tilhører, også kaldet den generiske epithet. Slægter er yderligere opdelt i arter, identificeret ved den specifikke epithet (den anden del af navnet). Kombinationen af disse to kategorinavne skaber det videnskabelige navn på organismer. Selvom Linnaeus ikke var (?) den første til at bruge det binomiale navnesystem, han var den første til at bruge det ofte nok til, at systemet blev accepteret og brugt oftere af forskere overalt.
Linneuss tanker om evolution er meget forskellige fra de moderne teorier., Han troede, at arter var uforanderlige. Selvom Linneus troede på uforanderlighed, troede han, at skabelsen af nye arter var mulig, men at den er begrænset. (?)
Linneus var far til taksonomisk og gav os det binomiale system for navngivning og klassificering af organismer.