gelelektroforese er en laboratoriemetode, der bruges til at adskille blandinger af DNA,RNA eller proteiner i henhold til molekylstørrelse. I gelelektroforese skubbes molekylerneat blive adskilt af et elektrisk felt gennem en gel, der indeholdersmå porer. Molekylerne rejser gennem porerne i gelen med en hastighed derer omvendt relateret til deres længder. Dette betyder, at et lille DNA-molekylevil rejse en større afstand gennem gelen end et større DNA-molekyle.,
som tidligerenævnt involverer gelelektroforese et elektrisk felt; især anvendes dette felt således, at den ene ende af gelen har en positiv ladning,og den anden ende har en negativ ladning. Fordi DNA og RNA er negativt ladetmolekyler, vil de blive trukket mod den positivt ladede ende af gelen.Proteiner er imidlertid ikke negativt ladede; når forskere vilseparate proteiner ved hjælp af gelelektroforese, skal de først blande proteinernemed et vaskemiddel kaldet natriumdodecylsulfat., Denne behandling gør theproteiner udfolde sig i en lineær form og belægger dem med en negativ ladning, som giver dem mulighed for at migrere mod den positive ende af gelen og være adskilt. Endelig, efter at DNA -, RNA-eller proteinmolekylerne er væretadskilt under anvendelse af gelelektroforese, kan bånd, der repræsenterer molekyler af forskelligestørrelse, detekteres.