Andr .s ru .o, en geotermisk videnskabsmand, har undersøgt kilden til varmen. Han lærte oprindeligt om det som barn fra sin bedstefar. Floden opretholder sin høje temperatur på trods af ikke at være i nærheden af nogen kendte aktive vulkaner eller geotermiske ventilationskanaler, som normalt giver geotermisk opvarmning til grundvand. På trods af sin unikke natur, National Geographic har beskrevet det som et helt naturligt træk: en ikke-vulkansk, geotermisk funktion, der flyder med unormalt høje hastigheder. Den dominerende teori for kilden til denne varme er fra jordens geotermiske gradient., At være tættere på jordens kappe, har underjordisk vand en tendens til at have en højere temperatur end overfladevand. Teorien er, at regnvand falder ned på overfladen af Ama .onas regnskov og finder dybt rodfæstede fejl, hvor det bevæger sig ned i skorpen. Vandet opvarmes således i overensstemmelse med den geotermiske gradient. Derefter føres det sandsynligvis til jordens overflade gennem Fejlfødte varme kilder, der fungerer til at varme op floden gennem dens strækning.