small nuclear ribonucleoproteins (or snRNPs) form the functional splicesome on pre‑mRNA and catalyze splicing.
a. ARN » U » y proteínas asociadas. Los ARN nucleares pequeños (arnns) tienen aproximadamente 100 a 300 nts de largo y pueden ser tan abundantes como 105 A 106 moléculas por célula. Se llaman U seguido de un entero. Los principales involucrados en el empalme son U1, U2, U4/U6 y U5 snRNAs. Se conservan desde la levadura hasta el ser humano., Los snRNAs están asociados con proteínas para formar pequeñas partículas nucleares de ribonucleoproteína, o snRNPs. Los snRNPs son nombrados por los snRNAs que contienen, por lo tanto los principales involucrados en el empalme son U1, U2, U4/U6, U5 snRNPs.
una clase de proteínas comunes a muchos snRNPs son las proteínas Sm. Hay 7 proteínas Sm, llamadas B / B’, D1, D2, D3, E, F, G. Cada proteína Sm tiene una estructura 3-D similar, que consiste en una hélice alfa seguida de 5 hebras beta. Las proteínas Sm interactúan a través de las hebras beta, y pueden formar un círculo alrededor del ARN.,
una secuencia particular común a muchos snRNAs es reconocida por las proteínas Sm, y se llama el»motivo de ARN Sm».
B. Uso de anticuerpos de pacientes con LES., Varios de los snRNPs comunes son reconocidos por el suero autoinmune llamado anti-Sm, generado inicialmente por pacientes con la enfermedad autoinmune Lupus Eritematoso Sistémico. Uno de los primeros experimentos críticos que muestran la importancia de snRNPs en el empalme fue la demostración de que anti-Sm antisueros es un potente inhibidor de las reacciones de vitrosplicing. Por lo tanto, los objetivos de los antisueros, es decir, las proteínas Sm en snRNPs, son necesarios para el empalme.
C. los snRNPs se ensamblan en el pre-ARNm para hacer un gran complejo de proteína-ARN llamado spliceosoma (figura 3.3.17)., La catálisis del empalme ocurre dentro del spliceosoma. Estudios recientes apoyan la hipótesis de que los componentes del snRNA del empalme en realidad catalizan el empalme, proporcionando otro ejemplo de ribozimas.
d. U1 snRNP: se une al sitio de empalme de 5′, y el ARN U1 forma una estructura emparejada con el sitio de empalme de 5′.
e. U2 snRNP: se une al punto de ramificación y forma un corto duplex ARN-ARN., Este paso requiere un factor auxiliar (U2AF) e hidrólisis de ATP, y compromete el pre-ARNm a la vía de empalme.
f. U5 snRNP plus the U4, U6 snRNP now bind to assemble the functional spliceosome. La evidencia indica que el snRNP U4 se disocia del snRNP U6 en el spliceosoma. Esto entonces permite que el ARN U6 forme nuevas estructuras emparejadas con el ARN U2 y el pre-ARNm que catalizan la reacción de transesterificación (transferencias de fosfoéster)., Un modelo es que el ARN U6 se empareja con el sitio de empalme de 5′ y con el ARN U2 (que a su vez está emparejado con el punto de ramificación), acercando así el punto de ramificación al sitio de empalme de 5′. El ARN U5 puede servir para mantener juntos los extremos de los exones a unir.