en mayo de 1999, durante la crisis de Kosovo, la embajada china en Belgrado fue bombardeada por error por la OTAN, desencadenando grandes manifestaciones Antiestadounidenses en Beijing. En el mismo mes, China fue acusada por los Estados Unidos de robar secretos de diseño nuclear que le permitieron acelerar sustancialmente su programa de armas. No obstante, en noviembre se firmó un acuerdo comercial con los Estados Unidos que condujo a la adhesión de China (2001) a la Organización Mundial del comercio. También en noviembre, China adelantó su programa espacial con el lanzamiento de prueba de una cápsula espacial no tripulada.,
Las relaciones con los Estados Unidos volvieron a ser tensas en Abril., 2001, después de que un caza Chino y un avión de vigilancia estadounidense chocaran en el aire, matando al piloto Chino. Tres meses más tarde, Rusia y China firmaron un tratado de amistad y cooperación que parecía en parte una respuesta a las ventas de armas de la administración de G. W. Bush a Taiwán y el impulso para desarrollar un sistema de defensa de misiles balísticos.
a partir de 2001, el Partido Comunista Chino comenzó otra transición, tanto en su Membresía como en su liderazgo., Ese año, Jiang Zemin instó al partido a reclutar empresarios como miembros, declarando en la doctrina de los tres representantes que el partido debe representar a los capitalistas además de los trabajadores y campesinos. Al año siguiente, Jiang renunció como líder del partido y fue reemplazado por Hu Jintao. Hu reemplazó a Jiang como presidente en 2003, y Wen Jiabao se convirtió en primer ministro. Jiang permaneció extremadamente influyente, sin embargo, tanto en el Partido como en el gobierno, y mantuvo su presidencia de las poderosas comisiones militares nacionales y del partido hasta septiembre., 2004.,
el manejo por parte del gobierno en 2003 de un brote de SARS (síndrome respiratorio agudo severo) que comenzó en la China Meridional dañó la imagen internacional de la nación cuando el brote no se reportó (y luego no se reportó), lo que le permitió propagarse más fácilmente. Las medidas severas instituidas posteriormente para frenar la enfermedad perjudicaron al sector de servicios de la economía, pero a finales de 2003 China había experimentado una tasa de crecimiento robusta de más del 9% y un gran auge de la construcción urbana, resultante en parte de la migración de habitantes rurales a las ciudades (22 ciudades tenían más de 2 millones de residentes)., En 2003, China e India firmaron un pacto fronterizo que representó una mejora gradual en sus relaciones, y dos años más tarde un nuevo acuerdo pidió la solución de los problemas fronterizos entre las dos naciones. También en 2003 se firmó un pacto comercial que daba a las empresas de Hong Kong un mayor acceso a los mercados de China. En Oct., 2003, China se convirtió en la tercera nación en poner un astronauta en órbita cuando Shenzhou 5, llevando a Yang Liwei, fue lanzado.,
la continuación del vigoroso crecimiento económico en 2004 llevó al gobierno a poner en práctica una serie de medidas destinadas a frenar el crecimiento para controlar la inflación y reducir el exceso de inversión. También en 2004, las relaciones con Taiwán se volvieron más tensas con la reelección de Chen Shui-bian, quien había pedido a Taiwán que declarara su independencia formal de China, como presidente de la isla. En Mar. En 2005, China aprobó una ley antisecesión que pedía el uso de la fuerza si los medios pacíficos no lograban la reunificación con Taiwán; la ley provocó protestas en Taiwán., Al mismo tiempo, China dio la bienvenida a las visitas de los líderes de la oposición Taiwanesa, que se comprometieron a seguir enfoques menos conflictivos en las relaciones con el continente.
a principios de 2005 también se incrementaron las tensiones con Japón sobre cómo las acciones japonesas durante la Segunda Guerra Mundial fueron tratadas en los libros de texto japoneses, sobre el posible nombramiento de Japón para un puesto permanente en el Consejo de seguridad de la ONU, y sobre una disputada Zona Económica Exclusiva en el mar de China Oriental. Los problemas provocaron manifestaciones a veces destructivas en China. Mientras tanto, en noviembre.,, 2004, China firmó un acuerdo de libre comercio con la Asociación de Naciones del Sudeste Asiático (ASEAN); en virtud del Acuerdo, los aranceles sobre muchos bienes se eliminarán con los miembros más ricos de la ASEAN para 2010 y con el resto para 2015. El comercio también fue un problema con los Estados Unidos, que pidieron a principios de 2005 (y posteriormente) que China revaluara su moneda debido a sus grandes desequilibrios comerciales con China, cuya economía continuó su crecimiento en auge durante el año siguiente., Las tensiones con Taiwán y Japón también continuaron en 2006, y el gobierno se preocupó cada vez más por la disparidad entre la China urbana más rica y la China rural más pobre, que se había vuelto aún más marcada desde el cambio de siglo y había provocado un número creciente de manifestaciones a veces violentas. El líder local del Partido Comunista de Shanghai, que también era miembro del Politburó, fue despedido en septiembre., 2006, por corrupción, pero la medida fue vista en gran medida como una consolidación del poder por el presidente Hu en lugar de un intento concertado de eliminar a los funcionarios corruptos.,
Prueba De Corea Del Norte de un arma nuclear en octubre., 2006, destacó las complejas relaciones de China con su vecino del noreste. Aunque se considera que China tiene más influencia que cualquier otra nación con Corea del Norte y se opuso a la prueba, no pudo evitarlo. Preocupada por la inestabilidad en la península de Corea y una posible afluencia de refugiados Coreanos al noreste de China, China apoyó una resolución condenando a Corea del Norte e imponiendo sanciones, pero expresó reservas sobre el registro de barcos norcoreanos y otro tráfico comercial., China, sin embargo, presionó al norte para que retrocediera en la realización de un segundo ensayo nuclear.
Las relaciones comerciales con los Estados Unidos volvieron a ser problemáticas en 2007. Tras un crecimiento económico extremadamente fuerte en 2006, que contribuyó al enorme superávit comercial y las reservas de divisas de China, los Estados Unidos, bajo una creciente presión interna, instituyeron aranceles sobre algunos productos chinos, afirmando que los productos estaban subvencionados ilegalmente. China denunció la medida, que parecía haberse hecho en parte debido a la renuencia de China a revaluar su moneda más rápidamente., En mayo de 2007, China anunció que aliviaría un poco las restricciones a la fluctuación diaria de su moneda, un movimiento en gran medida simbólico. Las relaciones con los Estados Unidos también se complicaron por una exitosa prueba de armas antisatélites chinas (Jan., 2007), que sugería que China podría paralizar los satélites de navegación y comunicación de Estados Unidos si los estadounidenses ayudaran a Taiwán en caso de una guerra chino-taiwanesa.