El Profesor Winthrop fue uno de los hombres más importantes de la ciencia en América durante el siglo 18, y su impacto en su avance temprano en Nueva Inglaterra fue particularmente significativo. Tanto Benjamin Franklin como Benjamin Thompson (Conde Rumford) probablemente debieron gran parte de Su interés temprano en la investigación científica a su influencia. También tuvo una influencia decisiva en la educación filosófica temprana de John Adams durante el tiempo de este último en Harvard., Mantuvo correspondencia regular con la Royal Society de Londres-como tal, fue uno de los primeros intelectuales estadounidenses en ser tomado en serio en Europa. Fue elegido miembro de la Sociedad Filosófica estadounidense revivida en 1768. Se destacó por tratar de explicar el gran terremoto de Lisboa de 1755 como un fenómeno científico—en lugar de religioso—, y su aplicación de los cálculos matemáticos a la actividad sísmica después del Gran Terremoto formó la base de la afirmación hecha en su nombre como el fundador de la ciencia de la sismología., Además, observó los tránsitos de Mercurio en 1740 y 1761 y viajó a Terranova para observar un tránsito de Venus. Viajó en un barco proporcionado por la Provincia de Massachusetts, probablemente la primera expedición científica enviada por cualquier estado estadounidense incipiente.
se desempeñó como presidente interino de Harvard en 1769 y nuevamente en 1773, pero cada vez declinó la oferta de la presidencia completa por motivos de vejez., Durante los nueve meses de 1775-1776, cuando Harvard se mudó a Concord, Massachusetts, Winthrop ocupó la casa que se haría famosa como The Wayside, hogar de Louisa May Alcott y Nathaniel Hawthorne. Además, estaba activamente interesado en los asuntos públicos, fue durante varios años juez de sucesiones en el Condado de Middlesex, fue miembro del Consejo del Gobernador en 1773-74, y posteriormente ofreció el peso de su influencia a la causa patriótica en la Revolución. Publicó:
- Conferencia sobre Terremotos (1755)
- Respuesta al Sr., Carta del príncipe sobre los terremotos (1756)
- cuenta de algunos meteoros ardientes (1755)
- dos conferencias sobre el paralaje (1769)