Das Land, das heute Eton ist, gehörte einst dem Herrenhaus von Königin Edith, der Frau von Edward dem Beichtvater. Das Land wurde von den Normannen nach 1066 angeeignet und von 1086 war der Herr der Sohn Anderer. Die Hauptstraße zwischen Windsor und London führte durch die Gegend und ein Weiler entstand inmitten von Weidelandwiesen, um die Straße und die Brücke zu erhalten.
1440 wählte Heinrich VI. Eton als Standort für sein neues College, das Eton College. Arbeiter wurden nach Eton verlegt, um das College zu bauen., Das gesamte Land unmittelbar um den Weiler herum wurde dem College gewährt, was das weitere Wachstum stoppte. Die neue College-Kapelle machte das Dorf zu einem Wallfahrtsort, und entlang der Hauptstraße wurden Gasthäuser errichtet. Henry VI gab dem College das Recht, Messen auf seinem Gelände abzuhalten.
Während des englischen Bürgerkriegs, nachdem Windsor Castle von parlamentarischen Kräften erobert worden war, zog die royalistische Armee nach Eton und versuchte, die Stadt zurückzuerobern, wobei sie das College besetzte. Die Bemühungen, Windsor zurückzuerobern, waren erfolglos und die Royalisten flohen schließlich.,
1812 wurde Pornys Wohltätigkeitsschule vom Nachlass des verstorbenen Antoine Pyron du Martré gegründet, ansonsten Mark Anthony Porny, französischer Meister am Eton College. Später Eton Porny genannt wurde es die Schule für lokale Kinder in 29 High Street. Im Jahr 1863 zog er an den heutigen Standort der Schule in der 14 High Street Eton.
Die Bevölkerung war 3.526 von 1841.
Das College mietete manchmal kleine Grundstücke als Wohltätigkeitsakt an das Dorf, was zum Bau von Häusern in der Nähe der Brücke führte. Gelehrte am College sammelten auch „Salz“ (Geld) von den Gasthäusern der Eton High Street., Diese Praxis dauerte bis 1845, als sich ein Gelehrter weigerte, sich den Gasthäusern anzuschließen, weil sie eine „Versuchung“ für Eton-Studenten darstellten. Eton wurde günstig modernisiert und war das erste Dorf in Großbritannien, das über ein eigenes Postamt und ein modernes Entwässerungssystem verfügte.
Bis 1925 wurde die Stadt als eher kommerziell als wohnhaft beschrieben, wobei die meisten Gebäude (abgesehen von denen der Schule selbst) Unternehmen gehörten, die den Schülern dienten.
Im April 1970 wurde die Windsor Bridge, die Eton mit Windsor verbindet, für den gesamten motorisierten Verkehr gesperrt., Der gesamte Verkehr muss jetzt über den Royal Windsor Way (formal die Windsor and Eton Relief Road) fahren, eine 1966 eröffnete Umgehungsstraße.