Das wissenschaftliche Denken von Carl Linnaeus begann mit der Naturtheologie. Aufgrund seiner religiösen Überzeugungen glaubte er, dass es möglich sei, ein Verständnis von Gott zu finden, indem er seine Schöpfungen betrachtete. In einem Teil von Systema Naturae erklärte er, wie er dachte, dass die göttliche Ordnung der Schöpfungen Gottes möglicherweise durch das Studium der Natur und ihrer Ursprünge offenbart werden würde.
Linnaeus ‚ Liebe zur Botanik brachte seine ersten taxonomischen Kategorien zu denen der Pflanzen. Er stützte jede Gruppe von Pflanzen auf die Anzahl und Anordnung der Fortpflanzungsorgane der Pflanze., Dies funktionierte nicht so gut, wie Linnaeus geplant hatte, da es ein System schuf, das in dem Sinne sehr unnatürlich war, dass es nicht viele andere Ähnlichkeiten und Unterschiede vergleicht, die für die Kategorisierung von Pflanzen wichtig sind. Er trennte zuerst die Pflanzen in eine große Gruppe (?), und dann kleinere Kategorien verwendet, um die Pflanzen weiter zu diversifizieren. Er gab jeder Pflanze zwei Namen, die der Ursprung der binomialen Nomenklatur sind. Diese Form der Klassifizierung wurde im Laufe der Jahre modifiziert und wird noch heute verwendet.
Die binomiale Nomenklatur besteht aus den beiden lateinischen Namen, die einem Organismus gegeben werden., Der erste ist der Name der Gattung, zu der der Organismus gehört, auch als generisches Epitheton bezeichnet. Gattungen werden weiter in Arten unterteilt, die durch das spezifische Epitheton (den zweiten Teil des Namens) identifiziert werden. Die Kombination dieser beiden Kategorienamen erzeugt den wissenschaftlichen Namen von Organismen. Auch wenn Linnaeus nicht (? er war der erste, der das Binomial Naming System benutzte, er war der erste, der es häufig genug benutzte, damit das System überall von Wissenschaftlern akzeptiert und häufiger verwendet wurde.
Linnaeus‘ Gedanken zur Evolution unterscheiden sich stark von den modernen Theorien., Er glaubte, dass Arten unveränderlich waren. Obwohl Linnaeus an Unveränderlichkeit glaubte, glaubte er, dass die Schaffung neuer Arten möglich war, aber dass sie begrenzt ist. (?)
Linnaeus war der Vater der Taxonomie und gab uns das binomiale System der Benennung und Klassifizierung von Organismen.