-
examiné par le Dr Tomislav Meštrović, MD, Ph.d.
La microréseau est une technologie récemment développée utilisée dans la recherche sur le cancer et dans le traitement pharmacologique d’autres maladies telles que les lésions buccales. Dans cette technologie, une lame de microscope (normalement une matrice 2D faite de verre, de puces de silicium ou de membrane en nylon) imprimée avec des milliers de taches minuscules dans des positions définies est utilisée.
©DAndre Nante/.,com
la puce à ADN (puce génétique, puce à ADN ou biopuce) est l’une de ces technologies qui mesure L’ADN ou utilise l’ADN dans le cadre de son système de détection. Dans chacune des taches de ce réseau, une séquence D’ADN ou un gène connu est organisé de manière ordonnée.
au total, les échantillons de tous les génomes d’un organisme peuvent être présents dans une seule diapositive. Une base de données informatique est ensuite utilisée pour enregistrer l’emplacement et la séquence de chaque spot. Ces séquences D’ADN sont comparées les unes aux autres pour obtenir les informations nécessaires., Cette technique permet aux chercheurs d’étudier et d’analyser l’expression de milliers de gènes en une seule réaction et de résoudre des problèmes qui ne seraient pas traçables.
Principe et Technique
le principe de base de la puce ADN est « l’hybridation des acides nucléiques”. Dans ce processus, deux brins complémentaires d’un ADN sont réunis par des liaisons hydrogène pour former une molécule double brin. Cela aide les chercheurs à comparer et à analyser les molécules D’ADN ou D’ARN de séquences identiques.,
La technique se compose de trois sections principales:
- Préparation d’une puce à ADN
- L’expérience
- la Collecte et l’analyse des résultats
- la Préparation de la puce à ADN et de l’expérience
Plusieurs méthodes sont utilisées pour préparer un spotted tableau. Dans certains cas, les sondes déjà conçues qui sont attachées à de fines aiguilles sont imprimées sur une surface de matrice chimique à l’aide d’un robot (ingénierie de surface). La chimie photoactivée et le masquage sont également utilisés pour fabriquer des sondes, et ceux-ci peuvent également être achetés dans les magasins.,
la procédure de réaction des puces à ADN se déroule en plusieurs étapes:
- prélèvement d’échantillons – un échantillon peut, dans ce cas, être défini comme la cellule / le tissu de l’organisme sur lequel nous souhaitons mener l’étude. Deux types d’échantillons sont collectés: les cellules saines et les cellules infectées, pour la comparaison et pour obtenir les résultats.
- L’isolement de l’ARNm – ARN est extrait de l’échantillon à l’aide d’une colonne ou d’un solvant comme le phénol-chloroforme. De L’ARN extrait, l’ARNm est séparé laissant derrière lui l’ARNr et l’ARNt., Comme l’ARNm a une queue poly-A, des perles de colonne avec des queues poly-T sont utilisées pour lier l’ARNm. Après l’extraction, la colonne est rincée avec un tampon pour isoler l’ARNm des billes. Le tampon perturbe les liaisons hybrides entre l’ARNm et les perles en perturbant le pH.
- création d’ADNc marqué – pour créer de l’ADNc (brin D’ADN complémentaire), la transcription inverse de l’ARNm est effectuée. Les deux échantillons sont ensuite incorporés avec différents colorants fluorescents pour produire des brins d’ADNc fluorescents. Cela aide à distinguer la catégorie d’échantillon des ADNc.,
- hybridation – les ADNc marqués des deux échantillons sont placés dans la puce D’ADN de sorte que chaque ADNc soit hybridé à son brin complémentaire; ils sont également soigneusement lavés pour éliminer les séquences non bornées.
- la Collecte et l’analyse
La collecte des données est effectuée à l’aide d’un scanner puces. Ce scanner se compose d’un laser, d’un ordinateur et d’une caméra. Le laser excite la fluorescence de l’ADNc, générant des signaux.
lorsque le laser scanne le tableau, la caméra enregistre les images produites., Ensuite, l’ordinateur stocke les données et présente les résultats immédiatement. Les données ainsi produites sont ensuite analysés. La différence dans l’intensité des couleurs pour chaque tache détermine le caractère du gène dans cette tache particulière.,les réseaux fournissent une mesure indirecte de la concentration relative
- En particulier pour les génomes de mammifères complexes, il est souvent difficile de concevoir des réseaux dans lesquels plusieurs séquences d’ADN/ARN liées ne se lient pas à la même sonde sur le réseau
- Un réseau D’ADN ne peut détecter que des séquences que le réseau a li> assemblage de séquences d’ADN
- techniques de séquençage d’ADN à haut débit
- séquençage au fusil de chasse
dernière mise à jour le 26 février 2019