Bonaparte était connu pour se préparer à une nouvelle guerre, et, deux jours avant qu’elle n’éclate, Nelson, en mai 1803, a reçu le commandement en Méditerranée, hissant son drapeau dans la victoire. Encore une fois, il devait bloquer Toulon, maintenant dans le but d’empêcher un rendez-vous entre les navires français là-bas avec ceux de Brest dans l’Atlantique et, après que L’Espagne a déclaré la guerre à la Grande-Bretagne, avec les navires espagnols de Carthagène et Cadix., Une force combinée de cette taille pourrait bien permettre à Bonaparte d’envahir L’Angleterre; et au début de 1805, Napoléon, qui l’année précédente s’était couronné empereur, ordonna aux flottes de converger à cette fin. Les escadrons français et espagnols devaient franchir le blocus britannique; courir vers les Antilles; et après avoir ravagé les possessions et le commerce Britanniques, retourner à travers l’Atlantique dans une seule flotte invincible pour détruire les Britanniques près D’Ouessant, une île au large de la Bretagne, et prendre le contrôle de la manche alors qu’elle était traversée par une armée d’Invasion de 350 000 hommes.,
en Mars, L’amiral Pierre Villeneuve, qui devait avoir le commandement général, sort de Toulon sous le couvert du mauvais temps et disparaît. Nelson partit à sa poursuite. Villeneuve écourte sa maraude, mais sa flotte est interceptée et endommagée par une escadre britannique. Ne parvenant pas à prendre le contrôle de la Manche, il courut vers le sud jusqu’à Cadix.
Nelson entre à Gibraltar, prend des dispositions pour le blocus de Cadix et retourne en Angleterre., Au cours de ses 25 jours au pays, il planifia la stratégie d’affrontement avec les flottes Franco-espagnoles qui semblait inévitable; 34 navires ennemis furent bloqués à Cadix par un nombre plus réduit sous les ordres de L’Amiral Cuthbert Collingwood. Bien que Napoléon, abandonnant le plan d’une invasion transfrontalière, ait commencé à redéployer la Grande Armée, en Grande-Bretagne, le danger d’invasion semblait plus pressant que jamais, et Nelson semblait l’espoir du pays.
lorsque ses ordres sont venus, Nelson le 15 septembre a navigué dans la victoire. Il était maintenant au sommet de ses pouvoirs professionnels., Adulé par ses officiers et ses marins, il était convaincu que ses capitaines comprenaient si bien sa pensée tactique qu’il faudrait un minimum de consultation. Le jour de son 47e anniversaire, il dîna 15 capitaines dans son navire amiral et exposa ses plans pour mener une « bataille de pell-mell” dans laquelle l’artillerie britannique et l’esprit offensif seraient décisifs. Il prévoyait d’avancer sur les flottes Franco-espagnoles en deux divisions pour briser leur ligne et les détruire au coup par coup. Ce fut l’abandon définitif de la tactique traditionnellement rigide de combat en ligne de bataille.,
Après avoir reçu L’ordre de Napoléon de briser le blocus, Villeneuve, le 20 octobre, quitta Cadix. Le lendemain, à l’aube, les flottes Franco-espagnoles se dressèrent contre le lever du soleil au large du Cap Trafalgar, et les Britanniques commencèrent à former les deux divisions dans lesquelles ils devaient se battre, l’une dirigée par Nelson, l’autre par Collingwood. Alors que les flottes adverses fermaient, Nelson fit son célèbre signal: « L’Angleterre s’attend à ce que chaque homme fasse son devoir., »La bataille de Trafalgar a fait rage à son plus féroce autour de la victoire, et un tireur d’élite français, tirant du mât du Redoutable, a tiré Nelson à travers l’épaule et la poitrine. Il a été porté ci-dessous au chirurgien, et il était bientôt clair qu’il était en train de mourir. Quand on lui a dit que 15 navires ennemis avaient été pris, il a répondu: « c’est bien, mais j’avais négocié pour 20. »Thomas Hardy, son capitaine de drapeau, embrassa son front en adieu et Nelson prononça ses derniers mots: » Maintenant, je suis satisfait. Dieu merci, j’ai fait mon devoir., »
bien que la victoire de Trafalgar ait finalement mis la Grande-Bretagne à l’abri de l’invasion, elle a été, à l’époque, éclipsée par la nouvelle de la mort de Nelson. Un pays déchiré par la douleur lui a donné des funérailles majestueuses dans la Cathédrale Saint-Paul, et sa popularité a été enregistrée dans d’innombrables monuments, rues et auberges portant son nom et, finalement, dans la préservation à Portsmouth de la victoire. Emma Hamilton et sa fille, cependant, ont été ignorés. Emma mourut, presque sans ressources, à Calais neuf ans plus tard., Horatia, montrant la résilience de son père, a épousé un pasteur à Norfolk et est devenue la mère d’une famille nombreuse et robuste.