a Missouria harcos a bal oldalon, Karl Bodmer
Missouria Old Fort a Van Meter állami parkban
a törzs szóbeli története azt mondja, hogy egyszer a Nagy-tavaktól északra éltek. A 16. században kezdtek délre vándorolni. 1600-ra a Missouri a Grand és Missouri folyók összefolyásánál lakott, ahol a 18.században telepedtek le., Hagyományuk azt mondja, hogy szétváltak az Otoe törzsből, amely a Siouan nyelv ugyanazon Chiwere ágához tartozik, két törzsi főnök gyermekei közötti szerelmi kapcsolat miatt.
a 17.század nehézségeket okozott a Missouri-nak. A Sauk és a róka gyakran támadta őket. Társadalmukat még inkább megzavarta a himlő és más Eurázsiai fertőző betegségek okozta magas halálesetek, amelyek az európaiakkal való érintkezést kísérték. A francia felfedező, Jacques Marquette 1673-ban felvette a kapcsolatot a törzzsel, és előkészítette az utat a franciákkal való kereskedelemhez.,
Missouria a Missouri folyótól nyugatra Osage területére vándorolt. Ez idő alatt lovakat szereztek és bölényekre vadásztak. A francia felfedező, Étienne de Veniard, Sieur de Bourgmont az 1720-as évek elején meglátogatta az embereket. feleségül vette Missouria főnök lányát. A közelben telepedtek le, és Veniard szövetséget kötött az emberekkel. 1723-ban építette Fort Orleans-t Kereskedelmi állomásként a mai Brunswick közelében, Missouriban. 1726-ig volt elfoglalva.
1730-ban a Sauk / Fox törzs támadása majdnem elpusztította a Missouriát, több száz embert megölve., A túlélők többsége az Otoe-val Egyesült, míg mások az Osage-hez és a Kansához csatlakoztak. Az 1829-es himlőjárvány után kevesebb mint 100 Missouria maradt életben, és mindannyian csatlakoztak az Otoe-hoz.
1830-ban és 1854-ben szerződéseket írtak alá az amerikai kormánnyal, hogy átadják földjeiket Missouriban. Áthelyezték az Otoe-Missouria rezervátumba, amelyet a Kansas-Nebraska határon a nagy kék folyón hoztak létre. Az Egyesült Államok 1876-ban és 1881-ben több földterületre kényszerítette a két törzset.
1880-ban a törzsek két csoportra oszlottak, a Prérifarkasokra, akik tradicionalisták voltak, és a Kvékerekre, akik asszimilálódtak., A prérifarkas az Iowa rezervátumban telepedett le indiai területen. A kvékerek egy kis különálló rezervátumot tárgyaltak indiai területen. 1890-re a prérifarkas zenekar nagy része újra csatlakozott a Quakershez. A Dawes-törvény értelmében 1907-re a törzsek tagjait nyilvántartásba vették, és háztartásonként egyedi telkeket osztottak ki. Az Egyesült Államok a törzs minden felesleges kommunális földjét “többletnek” nyilvánította, és eladta az európai-Amerikai telepeseknek. A törzs egyesült az Otoe törzzsel.,
a Curtis-törvény előírta a törzsi bíróságok és kormányok feloszlatását annak érdekében, hogy asszimilálják az embereket és felkészítsék a területet az államiságra, de a törzs 1900-ban létrehozta saját bírósági rendszerét. A Missouria elsősorban a 20.század elején gazdálkodott. Miután 1912-ben felfedezték az olajat a földjükön, az amerikai kormány sok törzset kényszerített a kiosztásukról.