22 éves korában Iwatani 1977-ben csatlakozott a Namco japán videojáték-kiadóhoz. Mielőtt csatlakozott, Namco megszerezte a jogot, hogy a japán részlege Atari, Inc. Nolan Bushnelltől, amely jogokat biztosít számukra a vállalat számos játékának, például a kitörésnek az egész országban történő terjesztésére. Ez példátlan siker lett a Namco számára, és arra késztette őket, hogy saját videojátékokat készítsenek házon belül, ahelyett, hogy más vállalatokra támaszkodnának, hogy játékokat készítsenek nekik. Iwatani érkezéskor a cég videojáték-fejlesztési részlegéhez került., Eredetileg Flipper gépeket akart létrehozni, azonban a Namco vezetői a szabadalommal kapcsolatos kérdések miatt elutasították az ötletet. Egyfajta kompromisszumként Iwatani számára megengedték, hogy a flipper koncepcióján alapuló videojátékot hozzon létre. Shigeichi Ishimura programozó segítségével Iwatani létrehozta a Gee Bee-t, amelyet 1978-ban adtak ki. Bár nem olyan sikeres, mint a vállalat remélte, Gee Bee segített a Namco-nak, hogy megszerezze a lábát a fokozatosan bővülő videojáték-piacon. Két folytatást 1979-ben adtak ki, a Bombabeet és a Cutie Q-t, amelyen Iwatani tervezőként dolgozott.,
1979 vége felé Iwatani csalódott lett a videojáték-ipar felé, azt gondolva, hogy a piac csak az erőszakos “háborús” játékok, például a Space Invaders, valamint a Pongra emlékeztető sportjátékok használatával vonzotta a férfiakat. Úgy döntött, hogy hozzon létre egy videojáték, hogy fellebbezett a nők, aranyos, színes karakter design, könnyen érthető játék, koncepciója alapján az evés. Dolgozik egy kis csapat kilenc alkalmazottak, Iwatani létre Pac-Man, teszt forgalmazott Május 22, 1980-ban pedig megjelent Japánban július Észak-Amerikában október., Míg Japánban csak mérsékelt sikernek bizonyult, a Namco saját Galaxianja felülmúlta, a Pac-Man csillagászati siker volt Észak-Amerikában, gyorsan több mint 100 000 arcade egységet értékesített, és minden idők legkelendőbb és legnagyobb bevételt hozó arcade játékává vált. A Pac-Man azóta minden idők legsikeresebb videojátékává és a cég védjegyévé vált. Megjelenése után Iwatani-t a Namco soraiban népszerűsítették, végül felelőssé vált a vállalat adminisztrációjának felügyeletéért., A Pac-Man sikere ellenére Iwatani nem kapott semmilyen bónuszt vagy fizetésváltozást. Gyakran ismétlődő történet az, hogy Iwatani dühösen hagyta el Namco-t, mert nem ismerte el a fizetését, amelyet hamisnak tartott.
Iwatani 1983-ban a Libble Rabble-t tervezte, egy iker-stick rejtvényfejtő, egy olyan játék alapján, amelyet gyermekkorában játszott. Iwatani azt állítja, hogy a Libble Rabble a kedvenc játék. Ő is dolgozott, mint egy gyártó a sok Namco arcade játékok, beleértve a Rally-X, Galaga, Pole Pozíciót, a Ridge Racer Idő Válság., 2005 áprilisától vendégprofesszorként az Oszakai Művészeti Egyetem karaktertervező szakán tanított. Iwatani 2007 márciusában hagyta el Namco-t, hogy teljes munkaidős előadóvá váljon a Tokiói Politechnikai Egyetemen. Iwatani 2007-ben tért vissza a Pac-Man gyökereihez, amikor kifejlesztette a Pac-Man Championship Edition-t az Xbox 360-hoz, amely állítása szerint az utolsó játék, amelyet fejleszteni fog.
2010.június 3-án a játékok fesztiválján Iwatani megkapta a Guinness World Records tanúsítványát a Pac-Man számára, amelynek világszerte a leginkább “érmés arcade gépek” vannak telepítve: 293,822., A rekordot 2005-ben állították fel, és 2008-ban rögzítették a Guinness World Records: Gamer ‘ s Edition-ben.