DNA microarray (Norsk)

• Anmeldt av Dr. Tomislav Meštrović, MD, Ph. D.

  microarray er et nylig utviklet teknologi som brukes i kreftforskning, og i den farmakologiske behandling av andre sykdommer som for eksempel p-lesjoner. I denne teknologien, et mikroskop skyv (normalt en 2D-array som er laget av glass, silisium sjetonger, eller nylon membran) trykt med tusenvis av liten flekker i bestemte posisjoner er brukt.

  ©DAndre Nante/ .,com

  DNA microarray (gen chip, DNA-chip, eller biochip) er en slik teknologi som enten tiltak DNA eller bruker DNA som en del av sitt system for gjenkjenning. I hver av de stedene i denne tabellen, en kjent DNA-sekvens eller gen er ordnet arrangert.

  Helt, prøver av hele genomet til en organisme kan være tilstede i en enkelt side. En datamaskin database er deretter brukt til å beskrive plassering og rekkefølge på hvert sted. Disse DNA-sekvensene er sammenlignet med hverandre for å få den nødvendige informasjon., Denne teknikken gjør det mulig for forskere å undersøke og analysere uttrykk for tusenvis av gener i en enkelt reaksjon og løse problemer som antas å være nontraceable.

  – Prinsippet og Teknikk

  Det grunnleggende prinsippet bak DNA microarray er «nukleinsyrehybridisering». I denne prosessen, to komplementære tråder av DNA er bundet sammen av hydrogen obligasjoner for å danne en dobbel-strandet molekyl. Dette hjelper forskere til å sammenligne og analysere DNA-eller RNA-molekyler av identiske sekvenser.,

  teknikken består av tre hoveddeler:

  1. Utarbeidelse av en DNA-chip
  2. eksperimentet
  3. Innsamling og analyse av resultater
  • Utarbeidelse av DNA-chip, og den eksperiment

  Flere metoder er brukt til å utarbeide et øye på tabellen. I enkelte tilfeller, allerede laget prober som er festet til fine nåler er skrevet ut på en kjemisk matrix overflaten ved hjelp av en robot (surface engineering). Photoactivated kjemi og maskering er også brukt til å lage prober, og disse kan også kjøpes fra butikker.,

  reaksjonen prosedyre av DNA microarray finner sted i flere trinn:

  1. Innsamling av prøver – et eksempel kan, i dette tilfellet, være definert som cellen/vev i organismen som vi ønsker å gjennomføre studien på. To typer prøver som er samlet inn: friske celler og infiserte celler, for sammenligning og for å få resultater.
  2. Isolasjon av mRNA – RNA er hentet fra eksempel ved hjelp av en kolonne eller løsemidler som fenol-kloroform. Fra den utpakkede RNA, mRNA er atskilt etterlater rRNA og tRNA., Som mRNA har en poly-A hale, kolonne perler med poly-T-haler er brukt til å binde mRNA. Etter utvinning, kolonnen er skylt med buffer for å isolere mRNA fra perler. Buffer forstyrrer hybrid bånd mellom mRNA og perler ved å forstyrre pH.
  3. Etableringen av merket cDNA – for å lage cDNA (komplementær DNA-tråd), revers transkripsjon av mRNA er gjort. Begge prøvene er så innarbeidet med forskjellige fluorescerende fargestoffer for å produsere fluorescerende cDNA tråder. Dette bidrar til å skille prøven kategori cDNAs.,
  4. Hybridisering – merket cDNAs fra begge prøvene er plassert i DNA microarray, slik at hver cDNA får hybridiserte til sin komplementære strand; de er også grundig vasket for å fjerne ubegrenset sekvenser.
  • Innsamling og analyse

  innsamling av data er gjort ved hjelp av en microarray skanner. Denne skanneren består av en laser, en datamaskin og et kamera. Laser interesserer fluorescens av cDNA, generere signaler.

  Når laser-skanner utvalg, kameraet tar bilder produsert., Deretter datamaskinen lagrer data og gir resultater umiddelbart. Dataene dermed produsert er deretter analysert. Forskjellen i intensitet av farger for hver spot bestemmer karakteren av genet i det aktuelle stedet.,dyrt

• matriser gi et indirekte mål på relativ konsentrasjon
• Spesielt for komplekse nukleære genomet, det er ofte vanskelig å utforme tabeller der flere beslektede DNA/RNA-sekvenser som ikke binder seg til de samme probe på tabellen
• EN DNA-matrise kan bare oppdage sekvenser som matrisen ble designet for å oppdage

Mer å Lese

• Alle DNA-Sekvensering Innhold
• DNA-Sekvensering
• DNA Sekvens Montering
• Høy gjennomstrømning DNA-Sekvensering Teknikker
• Hagle Sekvensering