Den vitenskapelige tenkning av Carl Linné begynte med naturlig teologi. På grunn av sine religioner tro, han mente at det var mulig å finne en forståelse av Gud ved å se på Hans kreasjoner. I en del av Systema Naturae, forklarte han hvordan han trodde at den guddommelige orden av Guds skapelser muligens ville bli avslørt ved å studere naturen og dens opprinnelse.
Linné’ kjærlighet i botanikk hadde med sin første taksonomisk kategorier til å være de av planter. Han baserte hver gruppe av planter på antall og plassering av anlegget er reproduktive organer., Dette fungerte ikke så godt som Linné planlagt fordi det opprettet et system som var veldig unaturlig i den forstand at det ikke sammenligne mange andre likheter og forskjeller som er viktige for kategorisering av planter. Han ble først skilt ut planter i en stor gruppe (?), og deretter brukt mindre kategorier for ytterligere å diversifisere planter. Han ga hver plante to navn som er opphavet til binomiske nomenklatur. Denne formen for å klassifisere har blitt endret opp gjennom årene og er fortsatt brukes i dag.
Binomiske nomenklatur består av de to latinske navn gitt til en organisme., Det første er navnet på slekten som organismen tilhører, også referert til som den generisk tilnavnet. Typene er videre delt inn i arter, som er identifisert av den spesifikke tilnavnet (den andre delen av navnet). Kombinasjonen av disse to kategoriene skaper det vitenskapelige navnet på organismer. Selv om Han var ikke (?) de første til å bruke den binomiske navnesystemet, han var den første til å bruke den ofte nok til at systemet til å bli akseptert og brukt mer ofte av forskere overalt.
Linné’ tanker om utviklingen er svært forskjellig fra den moderne teorier., Han mente at artene var uforanderlig. Selv om Han trodde på immutability, gjorde han mener at etablering av nye arter var mulig, men at det er begrenset. (?)
Han var far til taksonomisk og ga oss den binomiske systemet med å navngi og klassifisere organismer.