RFLP były bardzo przydatne do stosowania jako markery do śledzenia genomowego DNA, zarówno od ludzi, jak i innych zwierząt. O co chodzi? Więc zasadniczo, jeśli podążasz za sekwencją DNA, poszczególnych miejsc, serii od czterech do ośmiu kwasów nukleinowych, skutkuje miejscem ograniczenia, w którym enzym z bakterii może faktycznie wiązać i rozszczepiać to DNA. Więc dlaczego jest to przydatne? Cóż, możemy skorzystać z tego faktu, aby rzeczywiście szukać różnic między ludźmi, czy mają to miejsce enzymu restrykcyjnego, czy nie., Więc pojedyncza różnica bazy między dwoma osobami może spowodować albo obecność lub brak tego miejsca ograniczenia. Więc, jeśli wyizolujesz ten fragment DNA otaczający to miejsce od dwóch osób, od jednej z nich zostanie on przecięty przez enzym, a drugiej nie, a to spowoduje polimorfizm lub różnicę między tymi dwoma osobami. Zazwyczaj widzimy je lub monitorujemy, izolując DNA, przecinając je tym bakteryjnym enzymem ograniczającym i uruchamiając je na żelu za pomocą elektroforezy., W jednej osobie, bez strony enzymu, zobaczysz jeden zespół, a osoba, która ma stronę enzymu, zobaczysz dwa zespoły, reprezentujące dwa rozszczepione produkty. Więc te różnice w sekwencjach kwasów nukleinowych i miejscach wiązania enzymów restrykcyjnych oznaczają, że jest różnica w sekwencji między tymi dwoma osobami. Ta różnica w sekwencji nie musi oznaczać, że jest z nią związana choroba. To polimorfizm, który możemy wykorzystać do śledzenia dziedziczenia DNA.