Small nuclear ribonucleoproteínas (or snRNPs) form the functional splices on pre‑mRNA and catalyze splicing.
A. “U” RNAs e proteínas associadas. Pequenas RNAs nucleares (snRNAs) têm cerca de 100 a 300 nts de comprimento e podem ser tão abundantes quanto 105 a 106 moléculas por célula. Eles são nomeados U seguido por um inteiro. Os principais envolvidos em splicing São U1, U2, U4/U6, e U5 snRNAs. Eles são conservados de levedura para humanos., Os snRNAs estão associados com proteínas para formar pequenas partículas de ribonucleoproteínas nucleares, ou snRNPs. Os snRNPs são nomeados para os snRNAs que eles contêm, daí os principais envolvidos em splicing São U1, U2, U4/U6, U5 snRNPs.
Uma classe de proteínas comum a muitos snRNPs são as proteínas Sm. Existem 7 proteínas Sm, chamadas B/B’, D1, D2, D3, E, F, G. Cada proteína Sm tem uma estrutura 3-D semelhante, consistindo de uma hélice alfa seguida de 5 cadeias beta. As proteínas Sm interagem através das cadeias beta, e podem formar um círculo em torno do RNA.,
uma sequência particular comum a muitos snRNAs é reconhecida pelas proteínas Sm, e é chamado de “motivo de RNA Sm”.
B. utilização de anticorpos de doentes com LES. , Vários dos snrnp comuns são reconhecidos pelo soro auto-imune chamado anti-Sm, inicialmente gerado por pacientes com a doença auto-imune lúpus Eritematose sistémica. Um dos primeiros experimentos críticos mostrando a importância da snRNPs em splicing foi a demonstração de que anti-SM anti-soros é um potente inibidor de reações de vitrosplicação. Assim, os alvos do anti-soros, isto é, proteínas Sm em snRNPs, são necessários para a splicing.
C. As snRNPs juntam-se no pré-ARNm para fazer um grande complexo proteína-RNA chamado spliceosoma (figura 3.3.17)., Catálise de splicing ocorre dentro do spliceosome. Estudos recentes sustentam a hipótese de que os componentes snRNA do spliceosome realmente catalisam splicing, fornecendo outro exemplo de ribozimas.
D. U1 snRNP: Binds to the 5′ splice site, and U1 RNA forms a base‑parished structure with the 5′ splice site.
E. U2 snRNP: liga-se ao ponto do ramo e forma um duplex RNA-RNA curto. , Esta etapa requer um fator auxiliar (U2AF) e hidrólise ATP, e compromete o pré-ARNm para a via de splicing.
F. U5 snRNP plus the U4, U6 snRNP now bind to assemble the functional spliceosome. A evidência indica que o U4 snRNP dissocia-se do U6 snRNP no spliceosome. Isso então permite que o RNA U6 forme novas estruturas emparelhadas de base com o RNA U2 e o pré-mRNA que catalisam a reação de transesterificação (transferências de fosfoester)., Um modelo é que o RNA U6 pares com o local de splice 5′ e com RNA U2 (que por si só é emparelhado para o ponto de ramificação), trazendo assim o ponto de ramificação para perto do local de splice 5′. O RNA U5 pode servir para manter juntas as extremidades dos exons a serem unidos.