În 1493, în a doua călătorie, Cristofor Columb a descoperit Puerto Rico, o insulă pe care el a numit San Juan Bautista. În prima sa călătorie, Columb, după cum știm, a descoperit La Española (Hispaniola), care este astăzi țările din Haiti și Republica Dominicană., Într-o încercare eșuată de a ajunge la La Española în cea de-a doua călătorie, Columb a aterizat pe Puerto Rico, unde a fost primit de indienii Taíno, care erau din același grup etnic ca oamenii din La Española și celelalte insule din Caraibe.1
luni după ce au ajuns pe insulă, spaniolii au început procesul de colonizare a indienilor Taíno, condus de Juan Ponce De Leon, care a fost unul dintre conchistadorii care au venit cu Columb. Mai târziu, în 1508, de Leon a devenit primul guvernator al San Juan Bautista., În timpul acestui proces de colonizare, indienii Taíno nu au manifestat rezistență, deoarece credeau că spaniolii erau zei. Motivul pentru care i-au văzut pe spanioli ca zei a fost pentru că a existat o legendă Taíno care vorbea despre un moment în care zeii urmau să se ridice din apă pentru a da mântuire Taíno. Această legendă a facilitat procesul de colonizare pentru spanioli, deoarece nu au întâmpinat nici o rezistență nativă. Într-un timp scurt au creat sate și colonii. Până la începutul anilor 1500, băștinașii din Taíno lucrau în mine și plantații de aur., În 1514, Taíno a decis să ia problema în propriile mâini și să se revolte împotriva stăpânilor lor spanioli. Ceea ce a rezultat a fost unul dintre cele mai brutale genocide din istoria Americii Latine. Peste 25.000 de indieni Taíno au fost uciși de spanioli pe insula San Juan Bautista. Aceasta înseamnă că 85-90% din populația lor a fost ucisă în mâinile spaniolilor. După rebeliune, spaniolii au observat că nativii care au supraviețuit nu erau suficienți pentru a-și îndeplini cerințele de muncă. Ei au decis să caute o nouă forță de muncă.,2
după masacrul din 1514, spaniolii au observat că au nevoie de o nouă „forță de muncă”, așa cum și-au numit sclavii; așa că în 1518 au început să importe sclavi africani din Golful Guineei. Sclavii au început să ajungă pe insulă mai târziu în acel an și au devenit noua „forță de muncă” a spaniolilor, împreună cu numărul mic de indieni Taíno care au supraviețuit masacrului. Acest lucru a cauzat mai multe probleme, deoarece spaniolii și africanii au adus o varietate de boli pe insulă, cum ar fi varicela mică și rujeola., Aproximativ două milioane de indieni Taíno care au trăit pe insulele Caraibelor au murit din cauza acestor boli. Până la sfârșitul anilor 1500 nu au mai rămas indieni Taíno pe insula San Juan Bautista; numai copiii celor care s-au căsătorit cu spaniolii și africanii au supraviețuit. Desigur, Taíno, africanii și spaniolii s-au căsătorit de-a lungul timpului și acesta este motivul pentru care Portoricanii au astăzi o moștenire rasială atât de diversă; dar grupul rasial inițial Taíno a dispărut în jurul anului 1600., În acel moment, insula San Juan Bautista devenise una dintre cele mai importante colonii din Caraibe. Spaniolii aveau acum o modalitate de a-și exporta produsele în restul Caraibelor și Americii Latine prin această insulă, oferindu-le un avantaj economic. În mai puțin de treizeci de ani, spaniolii au luat țara Taíno, bărbați, femei și copii și au șters practic o întreagă populație de pe fața pământului., Majoritatea oamenilor îl consideră pe Cristofor Columb ca fiind unul dintre cei mai mari exploratori care au trăit vreodată și ca un fel de erou, dar au luat în considerare numeroasele civilizații din America care au fost afectate de el? Nu numai populația Taíno, ci și aztecii, Incașii și multe alte societăți din America au fost afectate semnificativ de acest moment Columbian din istorie.3