Small nuclear ribonucleoproteins (tai snRNPs) muodostavat toiminnallisen splicesome pre‑mRNA ja katalysoivat liittämiseen.
a.” U ” RNAs ja siihen liittyvät proteiinit. Pienet ydinrnat (snrnat) ovat noin 100-300 nts pitkiä ja voivat olla jopa 105-106 molekyyliä solua kohden. Niiden nimi on U, jota seuraa kokonaisluku. Suurimmat liittämiseen osallistuvat ovat U1, U2, U4/U6 ja U5 snRNAs. Niitä säilytetään hiivasta ihmiseen., Snrnat liittyvät proteiineihin muodostaen pieniä ydinribonukleoproteiinihiukkasia eli snRNPs: ää. Se snRNPs ovat nimetty snRNAs ne sisältävät, joten suurimpien mukana liittämiseen ovat U1, U2, U4/U6, U5 snRNPs.
yksi monille snRNPs: lle yhteinen proteiiniluokka ovat Sm-proteiinit. On olemassa 7 Sm proteiineja, joita kutsutaan B/B, D1, D2, D3, E, F, G. Jokainen Sm-proteiinia on samanlainen 3-D rakenne, joka koostuu alfa-helix, jonka jälkeen 5-beta-säikeitä. Sm-proteiinit vuorovaikuttavat beetasäikeiden kautta ja voivat muodostaa RNA: n ympärille ympyrän.,
tietyssä järjestyksessä yhteisiä monille snRNAs on tunnustettu Sm proteiineja, ja on nimeltään ”Sm-RNA-motiivi”.
B. vasta-aineiden käyttö SLE-potilailla., Useita yhteisen snRNPs ovat tunnustettu autoimmuunisairaus nimeltään seerumin anti‑Sm, aluksi syntyy potilailla, joilla on autoimmuunisairaus, Systeeminen Lupus Erythematosis. Yksi kriittinen aikaisin kokeita osoittaa, miten tärkeää on snRNPs vuonna liitos oli osoitus siitä, että anti-Sm antiseerumit on voimakas estäjä in vitrosplicing reaktioita. Näin ollen antiseerumien kohteita eli snRNPs: n Sm-proteiineja tarvitaan liittämiseen.
c. snRNPs kokoontuu mRNA: ta edeltävälle alueelle tehdäkseen suuren proteiini-RNA-kompleksin, jota kutsutaan spliseosomiksi (Kuva 3.3.17)., Splikeosomin sisällä tapahtuu splikeosomin katalyysi. Viimeaikaiset tutkimukset tukevat oletusta, että snRNA osat spliceosome oikeastaan katalysoivat liitos, joka tarjoaa toinen esimerkki ribozymes.
d. U1 snRNP: Sitoutuu 5′ liitos päällä, ja U1 RNA muodostaa pohja‑pariksi rakenne 5′ splice site.
e. U2 snRNP: sitoutuu haarapisteeseen ja muodostaa lyhyen RNA-RNA-dupleksin., Tämä vaihe vaatii apukertoimen (U2AF) ja ATP-hydrolyysin ja sitoo mRNA: ta edeltävän vaiheen liitosreittiin.
f. U5 snRNP plus U4, U6 snRNP nyt sitoa koota toimiva spliceosome. Todisteet osoittavat, että U4 snRNP eroaa U6 snRNP: stä spliceosomessa. Tämä mahdollistaa sitten U6-RNA muodostaa uusi pohja-pariksi rakenteita U2 RNA: n ja pre-mRNA, jotka katalysoivat transesteröinti reaktio (phosphoester siirrot)., Yksi malli on, että U6-RNA pareittain 5′ liitos sivuston ja U2-RNA: ta (joka itse on yhdistetty haara piste), jolloin oksan kohta On lähellä 5′ splice site. U5 RNA voi toimia lähellä toisiaan liittyvien eksonien päät.