Vuonna 1493, hänen toinen matka Amerikassa, Christopher Columbus löysi Puerto Rico, saari, että hän nimesi San Juan Bautista. Ensimmäisellä matkallaan Kolumbus, kuten tiedämme, löysi La Españolan (Hispaniola), joka on nykyään Haitin ja Dominikaanisen tasavallan maat., Epäonnistunut yritys päästä La Española hänen toinen matka, Columbus laskeutui Puerto Rico, jossa hän sai Taino-Intiaanit, jotka olivat samaa etnistä ryhmää kuin ihmiset, La Española ja muut saaret Karibialla.1
Kuukauden saavutettuaan Saarella, Espanjalaiset alkoi prosessi asettumaan Taino-Intiaanit, led-Juan Ponce De Leon, joka oli yksi valloittajat, jotka tulivat Columbus. Myöhemmin vuonna 1508 De Leonista tuli San Juan Bautistan ensimmäinen kuvernööri., Tämän prosessin aikana kolonisaation, Taino-Intiaanit eivät osoittaneet vastarintaa, koska he uskoivat, että Espanjalaiset olivat jumalia. Syynä he näkivät, Espanjalaiset kuin jumalia oli, koska siellä oli ollut Taino legenda, joka puhui aika, jolloin jumalat piti nousta vedestä antaa pelastuksen Taino. Tämä legenda helpotti espanjalaisten kolonisaatioprosessia, koska he eivät kohdanneet mitään syntyperäistä vastarintaa. Lyhyessä ajassa he olivat luoneet kyliä ja siirtokuntia. 1500-luvun alussa Taínon alkuasukkaat työskentelivät kultakaivoksissa ja plantaaseilla., Vuonna 1514, Taino päätti ottaa asiat omiin käsiinsä ja kapinoivat espanjan yliherruuteen. Tuloksena oli yksi Latinalaisen Amerikan historian julmimmista kansanmurhista. Espanjalaiset murhasivat San Juan Bautistan saarella yli 25 000 Taíno-intiaania. Tämä tarkoittaa, että 85-90 prosenttia heidän väestöstään oli kuollut espanjalaisten käsissä. Kapinan jälkeen espanjalaiset huomasivat, etteivät eloonjääneet alkuasukkaat riittäneet täyttämään työvaatimuksiaan. He päättivät etsiä uutta työvoimaa.,2
vuoden 1514 verilöylyn jälkeen espanjalaiset huomasivat tarvitsevansa uuden ”työvoiman”, kuten he kutsuivat orjiaan; niinpä vuonna 1518 he alkoivat tuoda afrikkalaisia orjia Guineanlahdelta. Orjat alkoivat päästä saarelle myöhemmin samana vuonna, ja tuli uusi ”työn voima” Espanjalaiset yhdessä pieni määrä Taino-Intiaanit, jotka olivat selvisivät verilöylystä. Tämä aiheutti lisää ongelmia, koska Espanjalaiset ja Afrikkalaiset toivat erilaisia sairauksia Saarelle, kuten pienen-rokko, ja tuhkarokko., Näihin tauteihin kuoli noin kaksi miljoonaa Taíno-intiaania, jotka asuivat Karibianmeren saarilla. Myöhään 1500-luvulla ei ollut enää Taino-Intiaanit jäljellä saarella San Juan Bautista; vain lapset, jotka naivat Espanjalaiset ja Afrikkalaiset selvisi. Tietenkin, Taino, Afrikkalaiset, ja Espanjalaiset naivat ajassa, ja tämä on miksi puertoricolaiset tänään on niin monipuolinen rodun perintöä; mutta alkuperäinen Taino rotuun ryhmä kuoli sukupuuttoon noin 1600., Siihen mennessä San Juan Bautistan saaresta oli tullut yksi Karibian tärkeimmistä siirtokunnista. Espanjalaiset nyt oli tapa viedä tuotteitaan muualle Karibian ja latinalaisen Amerikan läpi tämän saaren, antaa heille taloudellinen etu. Alle kolmekymmentä vuotta Espanjalaiset otti Taino maa, miehet, naiset, ja lapset, ja käytännössä poistetaan koko väestön maapallon., Useimmat ihmiset pitävät Christopher Columbus, koska yksi suurimmista explorer koskaan elää, ja sankari lajittelee, mutta he ovat ottaneet huomioon monia sivilisaatioita Amerikassa, joka on vaikuttanut häneen? Ei vain Taino väestöstä, mutta myös Atsteekit, Inkat ja monet muut yhteiskunnat kaikkialla Amerikassa vaikutti merkittävästi tämän Kolumbian historian hetkellä.3