Carl Linnaeuksen tieteellinen ajattelu alkoi luonnonteologiasta. Uskontokuntiensa vuoksi hän uskoi, että oli mahdollista löytää käsitys Jumalasta katsomalla hänen luomuksiaan. Osa Systema Naturae, hän selitti, miten hän ajatteli, että jumalallinen järjestys luomuksia Jumala olisi mahdollisesti paljastanut tutkimalla luontoa ja sen alkuperää.
Linnaeuksen rakkaus kasvitieteeseen toi hänen ensimmäiset taksonomiset kategoriansa kasvien kategorioiksi. Hän perusti jokaisen kasviryhmän kasvien lisääntymiselinten lukumäärään ja järjestelyyn., Tämä ei toimi niin hyvin kuin Linnaeus suunniteltu, koska se on luotu järjestelmä, joka oli hyvin luonnotonta siinä mielessä, että se ei verrata monia muita yhtäläisyyksiä ja eroja, jotka ovat tärkeitä luokitella kasveja. Hän erotti kasvit ensin suureksi ryhmäksi (?), ja sitten käytetään pienempiä luokkia edelleen monipuolistaa kasveja. Hän antoi kullekin kasville kaksi nimeä, jotka ovat peräisin binominimikkeistöstä. Tätä luokittelumuotoa on muutettu vuosien varrella ja sitä käytetään edelleen.
Binomisen nimistön koostuu kahdesta latinan nimet annetaan organismin., Ensimmäinen on nimi suvun, johon organismi kuuluu, myös nimitystä yleinen epiteetti. Suvut jaetaan edelleen lajeihin, jotka yksilöidään erityisellä epiteetillä (nimen toinen osa). Näiden kahden luokan nimien yhdistelmä luo eliöiden tieteellisen nimen. Vaikka Linnaeus ei ollutkaan (?) ensimmäinen käyttää binomisen nimeäminen järjestelmä, hän oli ensimmäinen, joka käyttää sitä riittävän usein, jotta järjestelmä hyväksytään ja sitä käytetään useammin tutkijat kaikkialla.
Linnaeuksen ajatukset evoluutiosta poikkeavat suuresti nykyajan teorioista., Hänen mukaansa lajit ovat muuttumattomia. Vaikka Linnaeus uskoi muuttumattomuuteen, hän uskoi uusien lajien syntymisen olevan mahdollista, mutta se on vähäistä. (?)
Linnaeus oli taksonomian isä ja antoi meille binomisen järjestelmän eliöiden nimeämiseksi ja luokittelemiseksi.