Nel 1946, l’IFBB è stata fondata dai fratelli Ben e Joe Weider a Montreal, Canada sotto il nome di “Federazione Internazionale dei Bodybuilder”. I due paesi fondatori erano il Canada e gli Stati Uniti. Il signor Ben Weider del Canada è stato il primo presidente dell’IFBB. Nel 1967 si tenne l’IFBB Mr. Olympia, che fu il primo concorso dell’IFBB. Dal 1966 al 1970, la Federazione conobbe una rapida crescita mentre Joe e Ben Weider promuovevano l’organizzazione a livello globale., Nel 1970, l’IFBB aveva direttori in più di 50 paesi in tutto il mondo e l’IFBB aveva la sua impronta in Africa, Asia, Europa, Australia, Nord America e Sud America.
Il 4 settembre 1970, l’IFBB tenne il suo 1 ° Congresso Internazionale a Belgrado, in Jugoslavia, dove fu adottata una Costituzione e un Consiglio Esecutivo. Nel 1971 Jim Morris divenne il primo bodybuilder professionista IFBB apertamente gay. Sempre nel 1971, l’IFBB divenne membro dell’Associazione Generale delle Federazioni Sportive Internazionali (GAISF), ora SportAccord., Dopo aver ricevuto l’adesione, l’IFBB è diventato l’unico rappresentante ufficiale del bodybuilding ad essere riconosciuto dalle autorità sportive mondiali. Dal 1980 alla sua morte nel 2008, il presidente IFBB Ben Weider ha presentato una petizione al CIO per l’inclusione del bodybuilding nei Giochi Olimpici. Anche se il bodybuilding non era mai stato nel programma olimpico, nel 1998, il CIO ha concesso il riconoscimento provvisorio IFBB, che è durato quasi quattro anni, ma è stato ritirato nel 2001.
Nel 2004, l’IFBB è stata rinominata Federazione Internazionale di Bodybuilding e Fitness, ma ha mantenuto l’abbreviazione “IFBB”., L’anno successivo, l’IFBB ha adottato nuove regole antidoping IFBB seguendo il Codice mondiale antidoping. La Sezione IFBB Professional è stata legalmente divisa dalla IFBB per formare la IFBB Professional League, una propria entità legale con le proprie regole e regolamenti. A sua volta, la Costituzione IFBB è diventato un documento di governo per lo sport amatoriale solo. Nel 2006, dopo 60 anni, Ben Weider si è dimesso dal suo ruolo di presidente e il Dr. Rafael Santonja dalla Spagna è stato eletto come nuovo presidente. La sede dell’IFBB è stata trasferita a Las Rozas (Madrid), Spagna., Nel 2010, Santonja è stato rieletto per un secondo mandato, e nel 2014, è stato rieletto per la terza volta al Congresso Mondiale IFBB a Brasilia.