kleine nucleaire ribonucleoproteïnen (of snrnp ‘ s) vormen de functionele splices op pre-mRNA en katalyseren splicing.
a. ” U ” RNAs en geassocieerde eiwitten. Kleine nucleaire RNAs (snRNAs) zijn ongeveer 100 tot 300 NTS lang en kunnen zo overvloedig zijn zoals 105 tot 106 molecules per cel. Ze worden U genoemd, gevolgd door een geheel getal. De belangrijkste die betrokken zijn bij het splitsen zijn u1, u2, U4/U6 en U5 snRNAs. Ze worden bewaard van gist tot mens., SnRNAs worden geassocieerd met proteã nen om kleine kernribonucleoproteindeeltjes, of snRNPs te vormen. De snrnp ’s zijn vernoemd naar de snrna’ s die ze bevatten, vandaar dat de belangrijkste die betrokken zijn bij het splitsen zijn u1, U2, U4/U6, U5 snrnp ‘ s.
Eén klasse eiwitten die veel snrnp ‘ s gemeen hebben, zijn de Sm-eiwitten. Er zijn 7 Sm-eiwitten, genaamd B / B’, D1, D2, D3, E, F, G. elk Sm-eiwit heeft een vergelijkbare 3-D-structuur, bestaande uit een alfa-helix gevolgd door 5 bèta-strengen. De proteã nen Sm interageren via de BÃ tabanden, en kunnen cirkel rond RNA vormen.,
een bepaalde sequentie die veel snrna ’s gemeen hebben, wordt herkend door de SM-eiwitten en wordt het”SM RNA-motief” genoemd.
b. gebruik van antilichamen van patiënten met SLE., Verscheidene gemeenschappelijke snRNPs worden erkend door het auto-immune serum genoemd anti-Sm, aanvankelijk door patiënten met de auto-immune ziekte systemische lupus Erythematosis gegenereerd. Een van de kritische vroege experimenten die het belang van snrnp ‘ s in splicing aantoonden, was de demonstratie dat anti-Sm antisera een krachtige inhibitor is van in vitrosplicing reacties. Aldus zijn de doelstellingen van de antisera, d.w.z. SM proteã nen in snRNPs, nodig voor het verbinden.
c. de snrnp ‘ s verzamelen zich op het pre-mRNA om een groot eiwit-RNA-complex te maken dat een spliceosoom wordt genoemd (figuur 3.3.17)., De katalyse van het verbinden komt binnen spliceosome voor. De recente studies steunen de hypothese dat de snrna-componenten van spliceosome eigenlijk het verbinden katalyseren, die een ander voorbeeld van ribozymes verstrekken.
d. U1 snRNP: bindt aan de 5′ splice site, en U1 RNA vormt een base‑gepaarde structuur met de 5′ splice site.
e. U2 snRNP: bindt aan het aftakpunt en vormt een korte RNA-RNA duplex., Deze stap vereist een hulpfactor (u2af) en ATP hydrolyse, en verbindt pre-mRNA aan de verbindende weg.
f. U5 snRNP plus de U4, U6 snRNP binden nu om het functionele spliceosoom te assembleren. Er zijn aanwijzingen dat U4 snRNP zich losmaakt van de U6 snRNP in het spliceosoom. Dit staat dan U6 RNA toe om nieuwe base-paired structuren met RNA U2 en pre-mRNA te vormen die de transesterificatiereactie (fosfoesteroverdrachten) katalyseren., Een model is dat U6 RNA paren met de 5 ‘splice plaats en met U2 RNA (dat zelf in paren wordt gebracht aan de tak punt), waardoor de tak punt een dicht bij de 5’ splice plaats. U5 RNA kan dienen om dicht bij elkaar de einden van te sluiten exons te houden.