Andrés Ruzo, een geothermische wetenschapper, heeft de bron van de warmte onderzocht. Hij leerde het in eerste instantie als kind van zijn grootvader. De rivier behoudt zijn hoge temperatuur, ondanks dat het niet in de buurt is van bekende actieve vulkanen of geothermische ventilatieopeningen, die normaal gesproken zorgen voor geothermische verwarming van het grondwater. Ondanks zijn unieke karakter heeft National Geographic het beschreven als een volledig natuurlijk kenmerk: een niet-vulkanisch, Geothermisch kenmerk dat abnormaal hoog stroomt. De belangrijkste theorie voor de bron van deze warmte is van de geothermische gradiënt van de aarde., Omdat ondergronds water dichter bij de aardmantel staat, heeft het een hogere temperatuur dan oppervlaktewater. De theorie is dat regenwater op het oppervlak van het Amazoneregenwoud valt en diepgewortelde breuken vindt waar het de korst in gaat. Het water wordt dus verwarmd in overeenstemming met de geothermische gradiënt. Het wordt dan waarschijnlijk gevoed aan het oppervlak van de aarde door fout-gevoede warmwaterbronnen die werken om de rivier op te warmen door haar strook.