webbplatsen och dess inland minskade och övergavs så småningom, förmodligen på grund av miljöförstöring, även om det har föreslagits att sjukdom, klimatförändringar, samhällelig stress och krigföring kan ha varit bidragande faktorer., Befolkningen ställde stora krav på träresurser för bränsle och konstruktion och, under de första århundradena av stadens ockupation, rensade skogarna uppströms platsen. Den denudade vattendelaren producerade kraftigt ökade nivåer av avrinning, erosion och oseasonable sommar översvämningar på cahokias fält, vilket ledde till att grödor misslyckades och den totala produktionen minskade. De ekonomiska och sociala konsekvenserna var katastrofala, vilket förmodligen ledde till svält, förlust av tro på ledarskap, ökad konkurrens om mark och regional krigföring., Under denna period byggde invånarna en serie palisaded Trä befästningar genom enorma ansträngningar-tydliga bevis på yttre hot som tidigare inte hade funnits. Staden övergavs långsamt, och dess passagerare flyttade till öst, syd och väst, där de troligen assimilerades av andra indianska grupper.,
arkeologer har studerat Cahokia sedan slutet av 1800-talet, men endast en liten andel av webbplatsen har grävts. Forskare har försökt att avgöra när varje högen byggdes och för vilka ändamål, hur och när eliten och gemensamma stadsdelar etablerades, hur de olika klasserna (t.ex. arbetare, hantverkare och eliter) interagerade och hur Cahokia interagerade med sitt inland, inklusive dess förorter., De har också försökt att exakt bestämma antalet personer som bodde på Cahokia (uppskattningar sträcker sig från en topp på 8 000 till 40 000) och samhällets yrkessammansättning. Ett tolkcentrum på platsen innehåller en nyskapad by och information om platsen. Bevarande insatser har fokuserat på att förvärva fler av högen områden för den statliga historiska platsen och bekämpa högen erosion, särskilt de katastrofala lutning misslyckanden som har inträffat på de östra och västra sidorna av munkar högen sedan mitten av 1980-talet.