1946, IFBB grundades av bröderna Ben och Joe Weider i Montreal, Kanada under namnet ”International Federation of Bodybuilders”. De två grundande länderna var Kanada och USA. Mr Ben Weider i Kanada fungerade som den första IFBB President. 1967 hölls IFBB Mr. Olympia, som var IFBB: s första tävling. Från 1966 till 1970 upplevde Federationen snabb tillväxt som Joe och Ben Weider främjade organisationen globalt., År 1970 hade IFBB regissörer i mer än 50 länder över hela världen och IFBB hade sitt fotavtryck i Afrika, Asien, Europa, Australien, Nordamerika och Sydamerika.
den 4 September 1970 höll IFBB sin första internationella kongress i Belgrad, Jugoslavien där en konstitution antogs och ett verkställande råd. 1971 Jim Morris blev den första öppet homosexuella IFBB professionell kroppsbyggare. Även i 1971, IFBB blev medlem av General Association of International Sports Federations (GAISF), nu SportAccord., Efter att ha fått medlemskap blev IFBB den enda officiella representanten för kroppsbyggnad som erkändes av världens idrottsmyndigheter. Från 1980-talet till sin död i 2008, IFBB president Ben Weider framställde IOC för införande av bodybuilding i de Olympiska Spelen. Även om kroppsbyggnad aldrig hade varit på det olympiska programmet, 1998 beviljade IOC IFBB provisoriskt erkännande, vilket varade nästan fyra år, men drogs tillbaka 2001.
år 2004 döptes IFBB till International Federation of Bodybuilding and Fitness men behöll ”IFBB” – förkortningen., Följande år antog IFBB nya ANTIDOPNINGSREGLER för IFBB enligt World Anti-Doping Code. IFBB Professional-sektionen delades juridiskt från IFBB för att bilda IFBB Professional League, sin egen juridiska enhet med egna regler och förordningar. I sin tur blev IFBB-konstitutionen ett styrande dokument för amatöridrotten. I 2006, efter 60 år, avgick Ben Weider från sin roll som president och Dr Rafael Santonja från Spanien valdes till ny president. IFBB högkvarter flyttades till Las Rozas (Madrid), Spanien., Santonja omvaldes 2010 för en andra mandatperiod, och 2014 omvaldes han för tredje gången vid IFBB: s världskongress i Brasilia.