Bonaparte era cunoscut ca pregătindu-se pentru un nou război și, cu două zile înainte de a izbucni, Nelson, în mai 1803, a primit comanda în Marea Mediterană, ridicându-și steagul în victorie. Încă o dată avea să blocheze Toulonul, acum cu scopul de a împiedica o întâlnire între navele franceze de acolo cu cele de la Brest în Atlantic și, după ce Spania a declarat război Marii Britanii, cu navele spaniole din Cartagena și Cádiz., O forță combinată de această mărime i-ar putea permite lui Bonaparte să invadeze Anglia; iar la începutul anului 1805, Napoleon, care în anul precedent se încoronase împărat, a ordonat flotelor să conveargă în acest scop. Escadrilele franceze și spaniole urmau să treacă prin blocada Britanică; să fugă spre Indiile de Vest; și după ce au devastat posesiunile și comerțul Britanic, să se întoarcă peste Atlantic într-o singură flotă invincibilă pentru a distruge britanicii lângă Ushant, O insulă din Bretania, și să preia controlul Canalului Mânecii în timp ce era traversat de o armată invadatoare de 350.000.,în martie, amiralul Pierre Villeneuve, care urma să fie în comanda generală, a izbucnit din Toulon sub acoperirea vremii nefavorabile și a dispărut. Nelson a pornit în urmărire. Villeneuve i-a scurtat jefuirea, dar flota sa a fost interceptată și avariată de o escadrilă Britanică. Nereușind să câștige controlul asupra Canalului Mânecii, el a fugit spre sud la Cádiz.Nelson a intrat în Gibraltar, a făcut dispoziții pentru blocada din Cádiz și s-a întors în Anglia., În timpul celor 25 de zile petrecute acasă, el a planificat strategia pentru confruntarea cu flotele Franco-spaniole care părea inevitabilă; 34 de nave inamice au fost blocate în Cádiz de un număr mai mic sub amiralul Cuthbert Collingwood. Deși Napoleon, abandonând planul unei invazii transversale, a început să redistribuie Marea Armată, în Marea Britanie pericolul invaziei părea la fel de presant ca niciodată, iar Nelson a apărut speranța țării.când au venit ordinele sale, Nelson, pe 15 septembrie, a navigat în victorie. El era acum la înălțimea puterilor sale profesionale., Venerat atât de ofițerii săi, cât și de marinari, el era încrezător că căpitanii săi înțelegeau gândirea sa tactică atât de bine încât era necesar un minim de consultare. La a 47-a aniversare a luat masa 15 căpitani în nava sa amiral și și-a prezentat planurile de a aduce o „bătălie pell-mell” în care artileria britanică și spiritul ofensiv ar fi decisive. El a planificat să avanseze pe flotele Franco-spaniole în două divizii pentru a le rupe linia și a le distruge bucăți. Aceasta a fost abandonarea finală a tacticii tradiționale rigide de luptă în linie de luptă.,după ce a primit ordinele lui Napoleon că trebuie să rupă blocada, Villeneuve, pe 20 octombrie, a plecat din Cádiz. În zorii zilei următoare, flotele Franco-spaniole au fost siluete împotriva răsăritului de pe Cape Trafalgar, iar britanicii au început să formeze cele două divizii în care urmau să lupte, una condusă de Nelson, cealaltă de Collingwood. Pe măsură ce flotele opuse se închideau, Nelson și-a făcut faimosul semnal: „Anglia se așteaptă ca fiecare om să-și facă datoria.,”Bătălia de la Trafalgar a făcut furori în jurul Victoriei, iar un lunetist francez, trăgând de pe catargul Redutabilului, l-a împușcat pe Nelson prin umăr și piept. El a fost dus mai jos la chirurg, și în curând a fost clar că el a fost pe moarte. Când i s-a spus că au fost luate 15 nave inamice, el a răspuns: „este bine, dar am negociat pentru 20.”Thomas Hardy, căpitanul său de pavilion, și-a sărutat fruntea în Rămas Bun, iar Nelson și-a spus ultimele cuvinte: „acum sunt mulțumit. Slavă Domnului, mi-am făcut datoria.,deși victoria lui Trafalgar a făcut în cele din urmă Marea Britanie în siguranță de invazie, a fost, la acea vreme, umbrită de vestea morții lui Nelson. Pavel, iar popularitatea sa a fost înregistrată în nenumărate monumente, străzi și hanuri numite după el și, în cele din urmă, în conservarea la Portsmouth a Victoriei. Emma Hamilton și fiica sa, cu toate acestea, au fost ignorate. Emma a murit, aproape nevoiașă, la Calais nouă ani mai târziu., Horatia, arătând rezistența tatălui ei, sa căsătorit cu un cleric din Norfolk și a devenit mama unei familii mari și robuste.